La terapia medica consiste di: digiuno prolungato, nutrizione parenterale esclusiva, terapia antibiotica ad ampio spettro e/o mirata per almeno dieci giorni. In circa un 1/3 dei neonati affetti è necessario l'intervento chirurgico. L'evidenza di pneumoperitoneo indica perforazione intestinale e richiede un intervento chirurgico urgente. Indicazioni assolute sono la perforazione intestinale (pneumoperitoneo) e/o i segni di peritonite. Altra indicazione all’intervento chirurgico è la stenosi intestinale post-NEC.
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