La terapia consiste nella somministrazione di ormoni tiroidei, in quantità adeguata a correggere il deficit presente. Il trattamento prevalente è basato sulla somministrazione di levotiroxina (T4). La levotiroxina (che si trasforma successivamente in T3) non determina bruschi aumenti della concentrazione plasmatica di T3, evitando così di determinare stimolazioni intense a livello cardiaco, che potrebbero essere pericolose nel paziente anziano o cardiopatico. E' opportuno comunque iniziare il trattamento sostitutivo con basse dosi di levo tiroxina, aumentandole ogni 2-3 settimane. La risposta viene valutata essenzialmente ricorrendo al dosaggio del TSH e del T3; alti valori di TSH indicano un trattamento insufficiente, alti valori di T3 un sovradosaggio.
Nell'ipotiroidismo neonatale infantile o giovanile è importante iniziare quanto prima la terapia sostitutiva, per evitare di compromettere uno sviluppo intellettivo ed una crescita normali. Un corretto trattamento dell'ipotiroidismo, diagnosticato precocemente, permette infatti uno sviluppo ed una crescita del tutto normali.
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